Godhavnsrapporten er en uafhængig granskning af en række klager rejst af medlemmer fra Landsforeningen Godhavnsdrengene over forholdene på 19 danske børnehjem i perioden 1945-1976. Undersøgelsen omfatter et grundigt interview- og arkivstudium af forholdene på Drenge- og Skolehjemmet Godhavn, samt punktstudier af 18 andre børnehjem. Undersøgelsen er finansieret af Socialministeriet og gennemført af Forsorgsmuseet ved Svendborg Museum under ledelse af museumsinspektør Maria Rytter.
Godhavnsrapporten er den første danske undersøgelse af overgreb mod børn under deres opvækst på børnehjem. Forhistorien til undersøgelsen går tilbage til 2005, hvor DR bragte et dokumentarprogram, hvori tidligere børnehjemsbørn og -medarbejdere fremlagde en række anklager om overgreb, vanrøgt og medicinske forsøg med psykofarmaka på Drenge- og Skolehjemmet Godhavn i 1960erne. Den efterfølgende debat førte til oprettelsen af Landsforeningen Godhavnsdrengene, der i flere år arbejdede for at få foretaget en uvildig undersøgelse af forholdene under deres medlemmers opvækst på børnehjem. Bestræbelserne bar frugt i 2010, og det er denne undersøgelse, der hermed fremlægges.